El principal problema que tiene el sector pesquero es el de la sobreex plotación, porque, con frecuencia, la extracción es tan intensa que el número de ejemplares que sobreviven no son suficientes para que la especie se recobre.
Los contaminantes pueden poner en peligro las zonas de baño, afectar a los criaderos de moluscos o a las pesquerías, eliminando especies de interés pesquero.
Suele ser más grave, ya que los productos químicos que llegan a los mares procedentes de la costa (detergentes, pesticidas, metales pesados, productos químicos, aceites, etc.) afec tan al sector pesquero.
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